“九五”期间主持课题
1 中科院生命科学特支项目“植物无性生殖习性的生态与进化研究”专题：植物无性生殖习性在典型草原中的作用，1.5万元，起止时间：1997年1月—1999年12月。
2 中科院重点项目“农牧交错带农牧业集约化技术体系研究”2级课题：草地畜牧业集约化技术体系研究，20万元，起止时间：1996年1月—2000年12月。
3 国家自然科学基金重大项目“内蒙古半干旱草原土壤—植被—大气相互作用”3级课题：半干旱草原温室气体与碳素循环研究，3万元，起止时间：1996年1月—2000年12月。
4 国家自然科学基金重点项目“全球变化的东北森林—草原样带研究”2级课题：锡林河流域羊草草原生物地球化学循环的实验研究，14万元，起止时间：1998年1月—2000年12月。
5 林业部GEF小型科研基金项目“锡林郭勒草原自然保护区蒙古黄羊生存现状与保护生物学机制研究”，4万元，起止时间：1997年1月—1999年12月。
“十五”期间主持课题
1 中科院知识创新工程重大项目“浑善达克沙地与京北农牧交错区生态环境综合治理试验示范研究”， 总经费1000万元，项目执行负责人；第3课题“京北农牧交错区生态保育与农牧耦合技术试验示范研究”，课题经费270万元，主持人；起止时间：2000年1月—2004年12月。
2 国家重点基础研究发展规划（973）项目“我国生存环境演变和北方干旱化趋势预测研究”,专题负责人，经费40万元，执行时间1999年—2004年。
3 国家重点基础研究发展规划（973）项目：草地与农牧交错带生态系统重建机理及优化生态—生产范式，专题承担人，经费70万元，执行时间2000年10月—2004年10月。
4 农业部948项目：基于3S技术的草场监测与管理决策支持系统，专题负责人，经费2万元，执行时间1999年—2001年。
“十一五”期间主持课题
1 中国科学院知识创新工程重大项目延续：“锡林郭勒草原适应性管理与可持续发展试验示范研究”，课题负责人，执行时间2006-2010年。
2 国家重点基础研究发展规划项目：“北方草地与农牧交错带生态系统维持与适应性管理的科学基础”， 首席科学家助理，经费2800万元，执行时间2007-2011年。
3 国家自然科学基金创新群体项目：“北方草地全球变化生态学研究”，骨干成员 。
4 国家自然科学基金面上项目：“典型草原植被-土壤系统中N同位素丰度对放牧梯度的响应格局与机理”，主持人，执行时间2007-2009年。
5 中国科学院“海外知名学者百人团队”项目，国内合作负责人 。
6 国家科技支撑计划项目“草业高效发展关键技术研究与示范”第一课题 ，专题负责人 。
